A Macross nevű űrhajó a Naprendszer pereme felől hazafelé tart a Földre. Közben idegenek támadják meg. Az idegenek döbbenten tapasztalják, hogy a hajóban együtt élnek férfiak és nők: számukra ez valami elképzelhetetlen dolog, náluk a férfiak és nők ősidők óta háborúznak egymással. Az egyik támadás során Hikaru Ichijo vadászpilóta megmenti Lynn Minmay popénekest, és úgy tűnik össze is jönnek, ám az események közbeszólnak.