Kibertron bolygóján alakváltó robotok, Autobotok és Deceptikonok háborúznak. A céljuk megszerezni a Mini-Konoknak nevezett apró lényeket, akik képesek különleges adottságokkal felruházni gazdájukat. Az Autobotok társulni akarnak velük, míg a Deceptikonok szolgasorsba hajtanák őket. A Mini-Konokat egy űrhajó fedélzetén a világűrbe lövik, s a háború így véget ér. Csakhogy a hajó rakománya a Földre zuhan, ahol több ezer év elteltével embergyerekek lelnek rájuk. Az Autobotok és Deceptikonok a Földre sietnek, hogy mihamarabb szert tegyenek a feléledt Mini-Konokra, és így a háború ismét elkezdődik.
