Licealista Kaito Kuroba uwielbia magię, co odziedziczył po swoim ojcu. Niestety ten zginął w tajemniczych okolicznościach. Po ośmiu latach Kaito dowiaduje się prawdy o podwójnej tożsamości ojca, który był Tajemniczym Złodziejem Kidem. Aby odkryć prawdę stojącą za jego śmiercią, chłopak staje się kolejnym Kidem.
