코난과 소년 탐정단의 반에 때아닌 부담임으로 와카세 선생님이 부임해 온다. 그런데 그 선생님은 어딘지 행동이 덜렁이 같고, 계속 엉뚱한 실수를 거듭한다. 그런데 그 선생이 코난과 애들한테 와서는 체육 시간에 피구 구장 라인을 그리기 위해 석회를 찾아봐도 다 떨어졌는지 없다며 도와달라고 찾아온다. 그러자 코난이 지금은 안 쓰는 옛날 창고에 가면 있을지 모른다고 하자 장난기가 발동한 애들은 그 옛날 창고는 귀신이 나올 거 같은 분위기라면서, 그리고 옛날에 거기 갇혀서 굶어 죽은 선생님이 있었다는 소문이 있다면서 선생님한테 겁을 준다. 그러자 와카사 선생님은 혼자 가기 겁이 나니까 코난과 애들에게 같이 가자며 조른다. 결국 선생님과 같이 옛날 창고로 가게 된 코난과 소년 탐정단. 그런데 거기서 정말로 무서운 광경을 목격하는데...